Pasantía biotecnológica en el uso de microarreglos de ADN aplicados a procesos de Biolixiviación - España

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2011-12-19

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El proyecto fue generado por la empresa Biotecnor Ltda., la cual cuenta como principales clientes a las compañías mineras de la II Región. El proyecto se elaboró en el marco de las actividades realizadas por el nodo de servicios medio ambientales y biotecnológicos de la corporación para el desarrollo productivo de la II Región de Antofagasta contando con el apoyo y supervisión de EuroChile como ESN. El proyecto se sustentó en base a que en la actualidad la industria de la minería se encuentra demandando análisis y tecnologías para poder entender de mejor forma las funciones metabólicas que presentan las comunidades microbianas en los procesos de biolixiviación, y de esta manera poder identificar actividades metabólicas claves que ayuden optimizar estos procesos. La manera en que importantes centros se investigación a nivel mundial identifican funciones metabólicas a nivel molecular es mediante el estudio de la expresión global de genes utilizando Microarreglos de ADN (DNA Microarrays). Esta técnica es una colección microscópica de “spot” con secuencias de ADN de un determinado organismo, que generalmente representan genes diferentes, y que se encuentran impresos mediante uniones covalentes a distintas matrices sólidas. Los análisis de microarreglos de ADN están basados en lo estricto de las hibridaciones de los ácidos nucleicos y en la detección mediante técnicas de fluorescencia. Los microarreglos de ADN son usados comúnmente para monitorear los niveles de expresión de miles de genes al mismo tiempo o para un análisis genómico comparativo. En los últimos años, los microarreglos de ADN pasaron a ser una tecnología poderosa para estudios de genómica funcional que actualmente es utilizada ampliamente en el monitoreo de la expresión de genes bajo diferentes condiciones de crecimiento, la detección de mutaciones específicas en secuencias de ADN y en la caracterización de microorganismos en muestras ambientales. Por lo tanto, esta nueva tecnología ha revolucionado los análisis genéticos en sistemas biológicos, y en un futuro se espera que esta tecnología revolucione el análisis de estructuras, funciones y dinámicas de comunidades microbianas. Este proyecto se planteó con la intención desarrollar e implementar a biotecnor Ltda. Técnicas avanzadas en biología molecular como son la amplificación de ARN y los microarreglos de ADN. Hasta la fecha este tipo de técnicas no han sido aplicadas en laboratorios chilenos que trabajen con muestras provenientes de procesos de biolixiviación o desde ambientes extremos. Estas técnicas ofrecen expectativas de desarrollo de nuevos métodos de análisis de funciones metabólicas de los microorganismos presentes en procesos de biolixiviación e industriales, lo que para biotecnor Ltda., significará un aumento de los servicios ofertados y la apertura de nuevas líneas de desarrollo. Por lo tanto, se planteó como objetivo general incorporar a biotecnor Ltda. herramientas potentes de última generación, como es el caso de los microarreglos de ADN, que puedan ser utilizadas en el estudio de la expresión genética en comunidades microbianas involucradas en proceso de biolixiviación

Description

La pasantía contempla una duración de 04 semanas y se desarrollará en el laboratorio de ecología molecular, perteneciente al centro de astrobiología de Madrid-España. El plan de trabajo del proyecto está compuesto por tres etapas: una primera que corresponde a procesamiento de ARN, una segunda etapa que involucra marcaje del ARN e hibridaciones en el micro arreglo de ADN y finalmente una tercera etapa de análisis de resultados utilizando la base de datos del laboratorio de ecología molecular. El desarrollo de la pasantía permitirá el desarrollo e implementación a Biotecnor Ltda. de técnicas avanzadas en biología molecular, como son la amplificación de ARN y los microarreglos de ADN, que hasta ahora no han sido aplicadas en laboratorios chilenos que trabajen con muestras ambientales.

Keywords

Genética en alimentos, Biología molecular, Microbiología

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